dores nos joelhos

comecei a treinar mais pesado há 3 meses.
Percebi ganhos significativos na parte superior do corpo, bem visível mesmo!
Porém as pernas não desenvolveram aparentemente nada! E pior, tenho sentido fortes dores nos joelhos qdo agacho mesmo sem pesos!
Meu treino de perna:
segunda:
agachamento livre 4x12 c/ 25kg de cada lado
agachamento unilateral a fundo 4x12 c/ mesmo peso
hack 4x12 carga leve (a fundo)
cadeira extensora 4x12 carga máxima
leg press baixo unilateral
quinta:
mesa flexora 4x12
cadeira flexora 4x12
stiff 4x12
e exercicios p gluteos

terça e quarta malho parte superior do corpo
sexta e quarta aeróbico

onde está o erro?
pq minhas pernas nao estão ganhando massa como meus braços??

Já faz um tempinho que a pergunta foi postada, mas de repente ainda posso ajudar...
Palavra de quem já perdeu muuuuuuitos treinos por conta de condromalacia patelar: alongamento intenso e pra sempre e ciclo de Joint Repair. Nem me lembro que tive esse problema um dia e olha que desço o pau nos treinos de perna, viu.

Como a Eve ja citou acima, procure alongar muito bem sempre,
e se voce não usa amplitude completa nos exercicios, passe a usar,
mas com carga leve.

A extensora e a leg baixa podem estar prejudicando seus joelhos,
deixe os dois fora por um periodo de 4-6 semanas, nao se preocupe,
não farão falta desde que o restante esteja sendo feito corretamente.

Nos agachamentos, muito cuidado com a postura, para nao sobrecarregar
os joelhos, alem da questao da amplitude citada acima.

E falando de modo geral, se nao ta ganhando massa nos membros inferiores,
mude a estrategia, procure outro metodo de treino.

Se ainda persistirem dores, procure um profissional qualificado para verificar
isso, eu diria até que ja poderia ir, é melhor pecar pelo excesso quando
a situação envolve dores e possivel lesao.